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科学・医療・心理 テーマ作成日：2006/02/01 16:54 / 投稿数：143 サイエンスやメンタルやメディカルなお話＆情報 このテーマで投稿する(FC2ブログユーザー)

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細胞とDNAを傷つける強い紫外線が「はるばる来たぜ！宇宙から〜〜」 2008/05/13 03:34 強調文京都のお寺で新茶を味わいながら紫外線のお話しをしようと思います 場所 妙心寺塔頭＜春光院（予定）＞ 日時 5月中旬から6月までの適当な日時（数名／1回） お茶＝静岡の無農薬茶、美味しい 続きを読む... 京都の安らぎとナノメディカルトーク

多重補正 (その１) 2008/05/12 23:06 多群におけるペアワイズによる検定や独立要素の同一仮説の繰り返し検定は多重検定と呼ばれます。例えば、患者群A, B, Cそれぞれの平均血圧に差があるか？AとBでは？AとCでは？BとCでは？と繰り返すこと 続きを読む... まめトーーク！

老婆のもみじ 2008/05/12 11:13 　節ぶしに　折れ曲がりながら　老婆のような手が 　神の手をつかむがごとく 　 　うすい青空に伸びる 　それは晩秋の赤茶けた紅葉 　おばあちゃん　おばあちゃんには　私がいるよ 続きを読む... 大切すぎる　あなた

機械文明 2008/05/11 21:28 コンバンワ、最近10チャンネルジキルとハイドに魅せられている、天城です。 人間は機械とうまく共存しようと日々努力しておりますね。 たとえば、二足歩行型ロボットや、身近なところでは携帯とか・・・ 続きを読む... まったり屋

Biomarker Discovery, Validation and Applications 2008/05/11 13:56 今年の２月に国際シンポジウム"Biomarker Discovery, Validation and Applications"に参加してきました。バイオマーカー研究／開発に関係する欧米の大学・公的研 続きを読む... まめトーーク！

地震緊急速報の実用上の困難性 2008/05/11 12:23 　５月８日未明に最大震度５弱を観測した地震で、強い揺れ（Ｓ波、主要動）の直前に予想震度を知らせる気象庁の「緊急地震速報」の発表は初期微動（Ｐ波）の検知から５８秒後で、揺れに間に合いませんでした。一般向 続きを読む... サイコロの面白さ

記憶障害 2008/05/10 19:40 これから記憶について書いていくことがあると思うので、その予備知識程度のものをざっと載せておきます。こんな感じなんだナーと軽く読んでくださいな。 詳しい説明（あんまり詳しくないけど）は下に畳んでいます 続きを読む... おまえのかーちゃんアドレナリン

KNIME 2008/05/10 17:09 データ解析のパターンをテンプレート化するソフトウェアがあります。データの取り込みや書き出し、フォーマット変換やフィルタリング、統計解析や機械学習などデータ解析に必要な機能はノードとして具現化され、各ノ 続きを読む... まめトーーク！

がんマーカーに求められる精度 2008/05/10 12:19 前回、バイオマーカーの評価法として陽性予測値（PPV）について書きました。同じ感度・特異度でも対象疾患の事前確率（有病率）の違いで、臨床における実用性が大きく異なることを示しました。下表は主要ながんに 続きを読む... まめトーク

解析ツール公開 2008/05/10 12:16 このブログで取り上げた解析に関する自作ツールを公開しました。 まずは、クライアントサイド (Javascript) で計算可能なツールを実装しました。計算量の多いものはCGIで提供する予定です。逐次 続きを読む... まめトーク

バイオマーカーの切れ味 2008/05/10 12:11 例えば、ある疾患を有する人と健常人を識別するようなスクリーニング目的のバイオマーカーの性能は以下のように評価します。 > TP (True Positive)：真陽性：病気の人を正しく 続きを読む... まめトーク

バイオマーカー候補 2008/05/10 11:41 タンパク質のがんマーカーに関する興味深いレポート。 A List of Candidate Cancer Biomarkers for Targeted Proteomics Malu Pol 続きを読む... まめトーク

Reciprocal Nearest Neighbor 2008/05/10 11:39 前回の階層型クラスタリングの話で変数の数が数万の場合、普通のPCではメモリ不足になると書きました。距離行列の空間オーダーはO(N^2)です。もう少し細かく計算すると距離行列は対象行列なのでN(N-1) 続きを読む... まめトーク

階層型クラスタリング 2008/05/10 11:34 階層型クラスタリングの代表的な手続きは以下の通り： 1. 距離を定義 2. クラスタリング手法を定義 3. 1.に基づきNearest Neighbor Pair (最も距 続きを読む... まめトーク

エンリッチメント 2008/05/10 01:47 発現差解析等で得られた分子リストがどのような特性を共有しているか、例えば、染色体上で近隣に位置している、同一パスウェイのメンバーである、生物学的イベント・分子機能・局在 (Gene Ontology) 続きを読む... まめトーク

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